Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AFDNP55196 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms