Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MANFP55145 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MANFP55145 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MANFP55145 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MANFP55145 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms