Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP2S1P53680 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP2S1P53680 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms