Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX2-5P52952 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX2-5P52952 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms