Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GSK3BP49841 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms