Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TTPAP49638 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTPAP49638 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTPAP49638 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTPAP49638 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TTPAP49638 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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