Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTAP49354 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTAP49354 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms