Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NR4A2P43354 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NR4A2P43354 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms