Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PIK3CBP42338 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PIK3CBP42338 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms