Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THBS4P35443 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THBS4P35443 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms