Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PCGF2P35227 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCGF2P35227 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms