Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA6P31267 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms