Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLIP1P30622 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLIP1P30622 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms