Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TM4SF1P30408 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM4SF1P30408 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TM4SF1P30408 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms