Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHC1P29353 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHC1P29353 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHC1P29353 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms