Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD34P28906 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CD34P28906 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CD34P28906 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms