Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCAP28676 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCAP28676 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCAP28676 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCAP28676 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCAP28676 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCAP28676 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCAP28676 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCAP28676 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms