Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSFA2P28290 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms