Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB4P28070 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms