Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB9P28065 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms