Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HRCP23327 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HRCP23327 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
HRCP23327 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
HRCP23327 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HRCP23327 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HRCP23327 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HRCP23327 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms