Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK11BP21127 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK11BP21127 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms