Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4BPBP20851 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4BPBP20851 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4BPBP20851 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C4BPBP20851 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms