Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRHP20396 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRHP20396 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRHP20396 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRHP20396 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRHP20396 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRHP20396 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRHP20396 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRHP20396 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms