Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMY2BP19961 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms