Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL3L1P16619 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCL3L1P16619 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL3L1P16619 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL3L1P16619 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL3L1P16619 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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