Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB4P16144 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms