Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2F2P13984 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms