Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGAMP11215 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms