Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms