Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIGD3P0DMS9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms