Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGPD1P0DJD0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGPD1P0DJD0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms