Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CT47B1P0C2W7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CT47B1P0C2W7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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