Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXB7P09629 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms