Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA2P01563 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms