Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WISP3O95389 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WISP3O95389 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WISP3O95389 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WISP3O95389 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WISP3O95389 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WISP3O95389 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WISP3O95389 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WISP3O95389 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms