Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCELO95171 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCELO95171 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCELO95171 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCELO95171 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms