Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AIREO43918 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AIREO43918 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms