Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF13O43567 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF13O43567 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF13O43567 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF13O43567 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms