Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS1O15524 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS1O15524 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms