Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNPHO15079 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms