Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2F3O00716 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms