Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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