Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms