Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms