Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD3A6NKT7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD3A6NKT7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms