Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TVP23AA6NH52 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms