Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC160A6NGH7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms