Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms