Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH73

IGKV1-12, Immunoglobulin kappa variable 1-12, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IGKV1-12A0A0C4DH73 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IGKV1-12A0A0C4DH73 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms